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起初，帝皇之子被称为第三军团，其新兵来自于神圣泰拉欧罗巴贵族家庭。
当时的欧罗巴贵族，将自己家族中最为优秀的年轻成员挑选出来，送给帝皇以表达他们被雷霆勇士击败
后对帝皇的致歉和敬意。
在欧罗巴贵族的带动下，其他贵族家族也纷纷把自己的孩子送到第三军团中去战斗。
据传，这是第三军团改名的来源，有帝皇的孩子之意，而在福根被找回后这个名字被再次确认。
和早期帝皇之子的一个区别是，统一战争时期的第三军团很愿意和普通的帝国军队合作甚至领导他们投入战斗，这在其他军团看来是一种值得鄙视的行为。
但对于这支“贵族军团”来说，领导“较弱”的部队似乎是一件理所应当的事情。
在原体和军团重新统一前，第三军团就以高效率的执行任务并往往能超出帝皇的期望而闻名。
大远征时期，第三军团经常被帝皇派去派去执行外交以及保护秘密大使的人物，并被有些人称之为帝皇的使者。
第三军团将他们的盔甲涂成紫色，以此象征他们的任务，并饰以雷电和烈日图案。
在一次某星球归顺帝皇的仪式中，帝皇和第三军团遭到了叛乱分子的攻击，第三军团XVI部队的星际战士为了保护帝皇被旋涡武器重创而牺牲。
之后帝皇将双头鹰授予第三军团作为对他们的忠诚